阿克苏红旗坡教学科研基地位于阿克苏红旗坡农场第十分场，占地面积500亩。建有综合办公楼、实验室、品种选育区、栽培试验区、新品种及栽培新技术示范展示区和技术服务中心等，总投资500余万元。为国家农业部农作物遗传改良中心新疆分中心和国家林木（苹果）良种基地。基地致力于苹果种质资源收集与保存、新优品种试验示范、高效栽培技术研究和推广，是我校在南疆特色林果产区科技创新、人才培养的基地和成果展示的窗口。